Τα σκυλιά εκτρέφονται σε ορισμένα φυσικά χαρακτηριστικά ιδανικά ή πρότυπα.
Σε κάποιο βαθμό, η ενδυνάμωση χρησιμεύει για τη βελτίωση και την τελειοποίηση μιας φυλής σκύλου, συνδυάζοντας δείγματα με εξαιρετικά χαρακτηριστικά. Εντούτοις, μπορεί επίσης να περιορίσει τη διαθέσιμη γονιδιακή ομάδα, η οποία προκαλεί προβλήματα, καθώς τα πολύ συγγενικά ζώα χρησιμοποιούνται σε γενεές για αναπαραγωγή σε μία γραμμή, όπως οι πατέρες που εκτρέφονται με κόρες ή τα αδέλφια που εκτρέφονται μαζί. Τέτοιου είδους κτηνοτροφία μπορεί να προάγει γενεές σκύλων που γίνονται άρρωστοι, οι οποίοι είναι στείροι ή που αναπτύσσουν δυνητικά θανατηφόρες αδυναμίες στο ανοσοποιητικό τους σύστημα.
Ζητήματα γονιμότητας
Ο επιφυλακτικός κτηνοτρόφος μπορεί να αναγνωρίσει, όταν η διασταύρωση έχει ξεπεράσει τα όριά της όταν τα θηλυκά σκυλιά αρχίζουν να παραδίδουν επανειλημμένα ανθυγιεινά, παραμορφωμένα ή μικρά γουρουνάκια ή όταν αυξάνεται σημαντικά το ποσοστό παιδικής θνησιμότητας. Επίσης, τα βαθιά αρσενικά σκυλιά τείνουν να έχουν μειώσει τη γονιμότητα, γεγονός που καθιστά την επιτυχή αναπαραγωγή πολύ δύσκολη. Μια ασυνήθιστη σκουπίδια δεν μπορεί να αποδοθεί από μόνη της στην αναπαραγωγή, αλλά αν συνεχιστεί από καιρό σε καιρό, η γενετική προδιάθεση είναι συνήθως η αιτία του προβλήματος.
Αναπαραγωγή για ειδικά χαρακτηριστικά
Η εκλεκτική αναπαραγωγή σημαίνει ότι ο κτηνοτρόφος έχει ένα σκύλο με μοναδικά χαρακτηριστικά και θέλει να επαναδημιουργήσει αυτά τα χαρακτηριστικά χρησιμοποιώντας οικογενειακά ζώα. Αυτό απαιτεί αναπαραγωγή μόνο σκύλων που φέρουν το μοναδικό χαρακτηριστικό στα γονίδιά τους. Αυτό απαραιτήτως περιορίζει την πιθανή γονιδιακή ομάδα, η οποία μπορεί τελικά να οδηγήσει σε παραμορφώσεις των οστών και εκφυλιστικές διαταραχές όπως η αρθρίτιδα. Άλλα σοβαρά προβλήματα περιλαμβάνουν τα κεφάλια που είναι πολύ μεγάλα για φυσικές γεννήσεις και μειωμένη ανοσία, γεγονός που καθιστά τα δείγματα πιο ευάλωτα σε ασθένειες.
Επιγονατιδική εξάπλωση και δυσπλασία ισχίων
Η επιγονατιδική εξάρθρωση είναι μια γενετική κατάσταση που περιλαμβάνει εξάρθρωση του καλύμματος του γόνατος που πλήττει κυρίως μικρά σκυλιά, όπως τεριέ Μπόστον και Γιορκσάιρ, Chihuahuas, πομεραρικά και μινιατούρα pudles. Αφορά αμφότερα τα γόνατα στις μισές περιπτώσεις, με αποτέλεσμα τον πόνο που προκαλεί ανησυχία. Η δυσπλασία είναι η κατάσταση της χαλαρής άρθρωσης του ισχίου, η οποία αναγκάζει το ισχίο να αποκολληθεί από την άρθρωση εύκολα. Αυτό συνήθως οδηγεί σε οστεοαρθρίτιδα ή εκφυλιστική αρθροπάθεια. Αυτές οι συνθήκες προκαλούν πόνο και αναπηρία σκύλου.
Δυσκολίες συμπεριφοράς και νοημοσύνη
Αν και όχι πάντα, η επιθετικότητα μπορεί συχνά να είναι ένα σοβαρό πρόβλημα με τα σκυλιά. Αυτό έχει ως αποτέλεσμα να δαγκώνει κανείς χωρίς λόγο, να επιτίθεται στους ανθρώπους, να κυνηγάει αυτοκίνητα ή ανθρώπους ή άλλα ζώα και να παίζει υπερβολικά. Τα συγγενικά σκυλιά έχουν συχνά πολύ χαμηλότερη νοημοσύνη από τα λιγότερο εγγενή μέλη της ίδιας φυλής. Αυτά τα σκυλιά μπορεί να είναι δύσκολο να εκπαιδευτούν, λόγω της μειωμένης νοημοσύνης τους, η οποία - που προστίθεται στη φυσική τους τάση προς επιθετικότητα - μπορεί να τα κάνει ανεπιθύμητα ως κατοικίδια ζώα.
